上古時期，黃帝、炎帝、蚩尤三大勢力原本相互抗衡，最後黃帝以仁德之政統御萬民。然而，戰爭並未就此結束，再度在戰亂紛呈的三國拉起開端，而一切的緣由，竟只因為一段上古未完的宿命糾葛。主角姬軒父母在八年前離奇失蹤，之後便由智者徐庶、與妹妹徐虹代替父母之位，照顧著他與姊姊姬霜。一日，卻因一場莫名的致命追殺，將原本生活單純的姊弟拋向混亂複雜的戰爭時代。

　　《幻想三國誌》在戰鬥系統的設計上，大幅將所需要的思維給單純化，即使是初學者的玩家，也不用因為害怕複雜的思考方式而望之怯步。遊戲中並開放了難度的選擇及戰鬥的計時喜好。不習慣即時戰鬥的玩家，則可以選擇『回合』制，有條斯理的做出正確的判斷。而喜歡重口味的老玩家，則可以選擇『半即時』及『高難度』來享受緊湊的刺激感。

　　陣形的發動，就是要改變目前我方的攻防效果，相對的也會帶來某種程度的缺陷弱點。陣形所帶來的攻防效果可分為『全體』及『個人』二種層面。陣形的發動是有門檻限制的，通常的門檻限制來自於我方人數。愈高級的陣形所需的門檻人數愈高，（四人陣、五人陣、六人陣），所附加的效果就愈高，但是相對的，陣法的維持也就愈不容易。如在發動六人陣時，只要我方其中一個人掛點，那陣形就崩潰。
　　《幻想三國誌》在戰鬥中可以隨意變換陣形，當【六人陣】被破之時，及時變更為【五人陣】或其它陣法，也能有其它的戰術效果。

　　遊戲中每個敵方人物都帶有『晶魄』，這些晶魄都具有不同的能力，只要將之鑲進適合的裝備之中，便可以發揮作用。裝備可分為『武器』『頭具』『甲胃』『靴子』及『裝飾品』。每個晶魄可以鑲崁的部位不同、大小不同、形狀也不同。在鑲崁時要注意裝備上洞的大小及形狀，如果跟晶魄相符合，便可以鑲於其中而得到其能力。而如果裝備上的晶魄之洞夠大，還可以鑲上許多個晶魄。
　　鑲崁及拔除的功能，玩家可以隨時在主介面的部份進行，但要注意的是，晶魄的拔除必需要損害自身的精元，功能愈強大的晶魄，所耗損的精元便愈高，這點在晶魄分配上必需要加以注意。

　
　　在戰鬥中如果出現了圍觀的ＮＰＣ（人、動物、敵人都有可能），他們可不只是看熱鬧這麼單純，這其中隱含了與玩家互動的機制。當玩家所使用的攻擊招式波及到旁邊的ＮＰＣ，就有可能會產生互動。
　　例如在襄陽城中，主角姬軒與貂芷的比武大會裡，就會有許多圍觀的群眾於戰鬥中吆喝起鬨，進而惹火咱們的女主角．貂芷。而在戰鬥過程中玩家所使用的招式如果波及到旁邊的路人，將可見到這些無辜的百姓被主角給打飛。運氣好的或許可以趁機撿到路人所遺落的珍貴物品，運氣差會惹火路人慘遭圍毆，受到意外的傷害。

　　遊戲中的各個階段，都插入了小遊戲，在遊戲進行了一段時間後，除了可以緩和情緒之外，還可以有不同的新鮮玩法及驚喜。例如在赤壁之戰前夕，玩家將經歷一連串緊繃的劇情，而到了草船借箭的部份，就可以改由小遊戲的進行來詮釋。
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小遊戲
戰場ＮＰＣ互動
組合變化晶魄系統
戰鬥陣形系統
新手、老手都適合的系統設計